《安徽中医药大学学报》（原名《安徽中医学院学报》）是由安徽省教育厅主管、安徽中医药大学主办的综合性中医药学术期刊。国内标准连续出版物号：34-1324/R；国际标准连续出版物号：ISSN 2095-7246。

《安徽中医药大学学报》创刊于1981年12月。试刊2期后，于1982年5月25日经中共安徽省委宣传部批准（皖宣字〔1982〕022号）成为正式刊物，国内公开发行；1987年改为国内外公开发行。1981－1995年为季刊（每季末月20日出版）；自1996年起改为双月刊（双月1日出版），64页；自2009年第4期页码增加至80页；自2010年第1期内文彩图随文彩色印刷；2011年12底本刊网站开通运行；2012年第4期页码增加至96页；2013年11月12日，经国家新闻出版广电总局同意（新出审字〔2013〕1414号），由《安徽中医学院学报》更名为《安徽中医药大学学报》；2021年第4期页码增加至104页；2024年第1期页码将增加至112页。

本刊从1993年起由铅印改为计算机排版，胶印。本刊除早期自办发行外，目前主要由邮局发行，邮发代号 26-23；国外发行自1989年起交中国教育图书进出口公司代理，国外代号 JNSC-44；1999年下半年起改由中国国际图书贸易总公司代理国外总发行，国外代号 BM6534。本刊读者遍及全国各地，并有部分国外订户。

本刊创刊后即组建了编辑委员会和编辑部。第一届编辑委员会主任委员：李毅；副主任委员：陈可望，高光鉴，刘中本；编委由17人组成。第二届编辑委员会主任委员：高尔鑫；副主任委员：王键；秘书长：马宗华；编委由37人组成。第三届编辑委员会主任委员：王键；副主任委员：彭代银，马宗华；顾问：高尔鑫，刘中本；编委由43人组成。第四届编辑委员会主任委员：王键；副主任委员：彭代银，李泽庚，刘新跃，马宗华；顾问：高尔鑫，刘中本，杨任民；编委由45人组成；还聘请了13位国内知名专家担任特聘编委。2013年《安徽中医学院学报》更名为《安徽中医药大学学报》，即组建了《安徽中医药大学学报》第一届和第二届编委会。目前第二届编委会主任委员：彭代银；副主任委员：李泽庚（常务），戴敏，魏骅，许钒，吴德玲；顾问：刘昌孝，石学敏，黄璐琦，徐经世，李业甫，杨任民，周逸平，刘青云，王元勋，曹恩泽，韩明向。学报编辑委员会对学报的发展及编辑出版工作起到指导、监督和咨询作用。

本刊编辑部开始名为编辑室，1993年更名为编辑部。本刊编辑部实行主编负责制。编辑部负责人先后有刘继武（主任）、张笑平（副主任）、王乐匋（主任）、吴沛昌（副主任）、马宗华（主任）、吴达武（主任）、周美启（主任）、姚实林（现任主任），编辑和编务人员先后有刘继武、张笑平、吴沛昌、夏学传、杨永持、马宗华、吴达武、邹守云、姚实林、许霞、曹健、张倩。目前编辑部共有3名专职编辑，均为硕士研究生及以上学历，主编和编辑部人员均为出版专业高级职称。

本刊坚持“以提高为主，注重实用，立足安徽，面向全国”的办刊方针，内容上突出中医药特色并体现安徽地方特色。经过对栏目不断调整，目前基本固定的有理论研究、文献研究、新安医学研究、临床研究、临床经验、针灸经络、实验研究、方药研究、教学研究、综述等。其中，新安医学研究等栏目在全国独具特色，深受广大读者欢迎。

本刊作为安徽中医药大学学术交流的窗口，在反映本校、本省中医药科研、医疗、教学成果与经验，促进校内外、省内外、国内外中医药学术交流，促进中医药科研成果转化为生产力，培养和造就中医药人才等方面，均起到了积极作用。

本刊得到上级主管部门多次表彰和奖励：1989年获全省高校自然科学学报三等奖；1990年获全国高等医药院校学报二等奖；1995年获全国高校优秀自然科学学报三等奖，全省高校优秀自然科学学报二等奖，全省优秀科技期刊三等奖；1998年获全省优秀科技期刊二等奖；1999年获全国优秀高校自然科学学报三等奖，全省高校优秀学报一等奖；2002年获安徽省优秀科技期刊三等奖；2004年获中国高等学校自然科学学报二等奖和安徽省高等学校自然科学学报二等奖；2005年获安徽省优秀科技期刊二等奖；2008年获第二届中国高校优秀科技期刊奖；2009年获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖和安徽省高校优秀学报二等奖；2011年本刊编辑部获“中国高校科技期刊优秀团队”称号；2012年获第四届中国高校优秀科技期刊奖；2013年获第二届中国高校优秀科技期刊网站奖及安徽省优秀科技期刊奖；2016年荣获“中国高校优秀科技期刊”（中国高校科技期刊研究会）、编校质量优秀奖（安徽省科技期刊编辑学会）；2017荣获“中国高校科技期刊优秀团队”（中国高校科技期刊研究会）；2018年荣获“优秀自然科学版学报（期刊）”（中共安徽省委教育工作委员会）、“中国高校优秀科技期刊”（中国高校科技期刊研究会）；2019年荣获“中国高校科技期刊优秀团队”（中国高校科技期刊研究会）；2020年荣获“安徽省优秀期刊”（安徽省期刊协会），2020年荣获“中国高校优秀科技期刊”；2021年荣获华东地区“优秀期刊”。2022年入选中国高校科技期刊建设示范案例库•优秀科技期刊。另外，本刊编辑人员曾多次受到国家教育部、卫生健康委、国家新闻出版署，安徽省科技厅、安徽教育厅的表彰和奖励。

本刊被列为《中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）》、《中国学术期刊影响因子年报》统计源期刊、《RCCSE中国核心学术期刊（A-）》（《中国学术期刊评价研究报告（武大版）》），并被《中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）》《中国期刊全文数据库（CJFD）》《中国核心期刊（遴选）数据库》《中国生物医学文献服务系统（SinoMed）》《日本科学技术振兴机构数据库（JST）》及美国《化学文摘》等数据库收录；2023年入选中华中医药学会T2期刊。